郑成功击败了清军部队，光复了镇江后，兵锋所至，无不望而归附，共计收复四府、三州、二十二县城。铁人部队功不可没。
此时郑成功便是郑森，此时郑森听到自己统帅的铁人军并没有被调走，心中一暖，看来昨夜的争执，并没有让父亲恼怒自己。
接着，郑芝龙命二弟郑芝虎、五弟郑芝豹为中营总兵官、副总兵，以郑芝虎统帅三千黑人火枪队，做为自己的亲卫队。以郑芝豹统领两千五百人的白奴重甲兵，拱卫中军。
三弟郑鸿逵、四弟郑芝鹏则被调去负责大军后勤辎重事务。
郑芝龙命甘辉、陈晖为中营参将，各统领一万五千骑兵。
同时郑芝龙将十七万步兵整编为前后左右四个营，命郑兴、郑明、杨耿、郑彩四人分别为前后左右四营总兵官，各统一营兵马。
至于三万多水手，以及三千多艘战船，则平均分为三支水师，号为水师左、中、右营，以施大瑄为水师左营总兵官，以施琅为水师中营总兵官，以洪旭为水师右营总兵官。
一番安排之后，众人并无异议，郑芝龙便大声说道：“好！诸位从今日开始，便开始正军备战，各营尽快完成整编，以中营各部随我前往福州驻守，其余各营，以前营驻扎在建宁府、福宁府，以后营驻扎在邵武府和汀州府，左营、右营驻扎在延平府。”