如此一来，朱元璋有了新的烦恼。
在给沐英等三将的敕谕中，朱元璋既为他们的工作业绩感到满意，又道出自己内心的担忧：“自将军南征，大军所至，势如破竹，蛮獠之地，次第底平。朕观自古云南诸夷，叛服不常，盖以其地险而远，其民富而狠也。驯服之道，以宽猛适宜。”朱元璋并非杞人忧天，云南远在千里之遥，地盘打下来，总要派人管理。
此时，明朝迫切需要选派一个“名臣重望者”镇守云南，执行中央的政策。这个人选，与朱家有着特殊关系的沐英再合适不过了。明军班师时，朱元璋特命沐英留下，镇守云南，这一特殊的任命将改变一个家族的命运。
平滇后的第二年，沐英入京。朱元璋关切地问：“官云南苦否？”
沐英从容答道：“云南不苦，四季如春，冬不穿袄，夏至温和。那里溪水清凉可口，喝多了也不会肚子痛。不过，臣还记得，打大理那天早上，将士心切，置生死于不顾，有百余将士打完仗后拉了一裤的稀。”朱元璋大笑，果然“儿子”还是靠得住。
